与DNA检测不同，mRNA检测并非分析基因序列，而是检测基因要产生「蛋白质」前中间产物- mRNA的产量。当细胞在活动时，基因就会具有高度活性，为了要产生足够的蛋白质「做工」，所以mRNA的产量也会上升，藉由侦测与疾病相关的mRNA分子标记的产量，就可评估身体目前的状况，如是否罹病、疾病目前状态、治疗状况等等。